|
Chcesz wiedzieć więcej? Zamów dobrą książkę. Propozycje Racjonalisty: | | |
|
|
|
|
Nauka » Biologia » Biologia molekularna
Priony. Czyżby nowożytny miecz Damoklesa? [2] Autor tekstu: Krzysztof Pochwicki
Więcej wiadomo o modyfikacjach posttranslacyjnych prionów. Do białka PrP
przyłączane zostają części cukrowe oraz lipidowe (dzięki nim zakotwicza się w błonie komórkowej od strony cytoplazmy).
W komórkach może również wystąpić druga izoforma prionu (alternatywna struktura
przestrzenna), jest ona jednak infekcyjna („scrapie") — ozn. PrPSc
(zamienne symbole: PrPres, PrPd, Sc). Izoforma ta jest
przyczyną chorób pionowych.
Wcześniej uważano, że różne formy przestrzenne białka prionowego są wynikiem
alternatywnego składania eksonów — zjawiska spotykanego często, szczególnie u ssaków. [ 13 ]
Okazało się, że sekwencje aminokwasów obu form białka PrP są identyczne. Było to
pierwsze białko, dla którego zaobserwowano takie zjawisko. Jest to zarazem jedna z najważniejszych cech prionów.
Wspomniana forma infekcyjna („scrapie") charakteryzuje się obecnością
rozbudowanej, w porównaniu do struktury PrPc, β-kartką oraz odznacza
się mniejszą zawartością α-helisków. Nie są to jedyne różnice. Struktury te
cechuje także różna rozpuszczalność w wodzie i podatność na trawienie enzymami
proteolitycznymi (tzw. proteazy; dokonują hydrolizy wiązań peptydowych). Forma
PrPSc wytrąca się w środowisku wodnym i jest odporna na
proteolizę. Ma to poważne konsekwencje w patogenezie chorób prionowych.
Tabela [ 14 ]
|
Forma PrPc |
Forma infekcyjna PrPSc |
Rozpuszczalne
w środowisku wodnym
|
Tak |
Nie |
Podatne na trawienie proteazami |
Tak |
Nie |
Dominująca struktura drugorzędowa |
α-heliks |
β -kartka |
Istnieje cała grupa chorób układu nerwowego, w których czynnikiem sprawczym są
tzw. patologiczne konformery (białka o nieprawidłowej konformacji);
nieoficjalnie używa się niekiedy przenośni „nowotwory białek". Białka mające
właściwość zmiany kształtu innych białek nazywane są chaperonowymi. Prion nie
jest więc wyjątkiem, jego specyfiką jest fakt, iż zmieniając swą konformację
staje się zakaźny!
Rozwiązanie struktury PrP nastąpiło głównie dzięki technice spektroskopii
rezonansu magnetycznego. Natomiast w przypadku formy patogennej nie możemy
uzyskać jej roztworu, ani kryształu przez co spektroskopia, krystalografia stają
się bezużyteczne; dowodów pośrednich dostarczają
inne metody, np. diploizmu kołowego. Cząstka prionu składa się z około tysiąca
monomerów, jeśli rzeczywiście zawiera jakiś odcinek kwasu nukleinowego to ma
długość on nie więcej niż 200 nukleotydów. [ 15 ]
Aby w pełni zrozumieć istotę prionów przybliżę wpierw strukturę białek.
Struktura białka:
-
I-rzędowa — in. pierwotna; łańcuch polipeptydowy
zsyntetyzowany przez rybosom w procesie translacji (biosyntezy); sekwencja
aminokwasów w łańcuchu białkowym. Struktura ta zapisana jest w genie kodującym
układ aminokwasów danego białka, a utrzymują ją kowalencyjne wiązania peptydowe
[ 16 ];
[ 17 ]
Rybosom — organellum w którym powstają białka
Mechanizm działania rybosomu
(schemat ukazuje translację mRNA; fazę elongacji) [ 18 ]
-
II-rzędowa — ułożenie poszczególnych fragmentów
w przestrzeni, utrzymywana przez wiązania wodorowe między aminokwasami.
Najbardziej stabilne układy przestrzenne (tzw. układy regularne) to alfa helisa
(a-helisa) i kartka beta (struktura
b,
zwana też harmonijkową).
Nazwa
struktury |
Wiązania |
a-helisa |
Wiązania
wodorowe między grupami =C=O jednego aminokwasu, a grupą =N-H innego,
odległego o 4 jednostki aminokwasowe; struktura ta jest częsta w
białkach globularnych /kulistych/, np. w hemoglobinie, mioglobinie
[ 19 ]. |
Kartka b |
Wiązania
wodorowe między równoległymi łańcuchami polipeptydowymi; struktura ta
umożliwia np. zmianę kierunku łańcucha w przestrzeni, tzw.
„zakręty". Tworzone przez nią białka są zwarte, nierozciągliwe
i nierozpuszczalne w wodzie, znaczny udział tej
struktury stwierdzono m.in. w fibroinie jedwabiu. |
Struktura a-helisa [ 20 ]
Struktura kartka b [ 21 ]
-
III-rzędowa — in. konformacja — przestrzenne pofałdowanie
łańcucha struktury
a-helisu
wynikające z oddziaływań między resztami R niektórych aminokwasów (konkretnie
mogą to być wiązania jonowe, oddziaływania hydrofobowe, mosteczki dwusiarczkowe
powstające między parą cystein w tej samej cząstce białka Cys-Cys, czy
oddziaływania van der Waalsa). [ 22 ]
-
IV-rzędowa — dotyczy tylko białek budowanych przez kilka
dużych podjednostek (np. hemoglobina), łańcuchy polipeptydowe łączą się w jedną,
funkcjonalną całość (in. łańcuchy o strukturze III-rzędowej tworzą układ
przestrzenny).
[ 23 ]
Struktura hemoglobiny
Przyjmuje się, że prion nabiera cech patogennych w wyniku nagłej zmiany
struktury trzeciorzędowej (łańcuch polipeptydowy); przy czym nie dotyczy to
sekwencji aminokwasowej, przeobrażeniu ulega przestrzenna forma cząsteczki,
stając się tzw. PrPSc -prionem powodującym scrapie(in.
skarpie), chorobę występującą u kóz i owiec.
Konformacja białka PrP [ 24 ]
Konwersja PrPc do PrPSc następuje po ponownym wejściu
cząsteczki do komórki poprzez jamkowe domeny lub wyłożone latryną zagłębienia.
Tak więc prion może być izoformą normalnego białka lub produktem zmutowanego
genu, aczkolwiek mechanizm powstawania formy PrPSc wymaga jeszcze
wielu badań. Tak naprawdę wciąż nie wiemy jak to się odbywa. Zaproponowano model
tłumaczący to zjawisko. [ 25 ]
Otóż białko PrP przyjmuje dwie formy przestrzenne, których zmiana jest procesem
spontanicznym. Forma PrPc nie posiada zdolności tworzenia „polimerów" w przeciwieństwie do formy infekcyjnej, która przy udziale β-kartki może
przyłączać kolejne cząsteczki tego białka. Proces ten jednak jest całkowicie
odwracalny do momentu osiągnięcia przez polimeryzujące molekuły PrPSc
rozmiaru krytycznego. Osiągnięcie takiego rozmiaru oznacza, że polimer
cząsteczek PrPSc nie może już się zmniejszyć, nie ma wówczas
możliwości powrotu do konformacji PrPc. W ten sposób powstają tzw.
złogi β-amyloidowe (beta-amyloidowe), stanowiące według wielu
badaczy przyczynę m.in. choroby Creutzfeldta-Jakoba (CJD). [ 26 ]
Złogi te niekiedy pękają i są przekazywane do komórek potomnych przy podziale
komórkowym. [ 27 ]
Tak więc reasumując, mechanizm szkodliwości prionów zakaźnych (neurotoksyczność)
polega na gromadzeniu się ich w komórkach, w błonach wakuol,
zaburzeniu recyrkulacji błon oraz akumulowaniu zewnątrzkomórkowo w postaci tzw.
beta-amyloidu. Przypuszczalnie przyczyniają się do indukcji apoptozy neuronów,
powodują zaburzenia glikozylacji i metabolizmu PrP.
Naukowcy stwierdzili że priony są białkami, które wnikając do komórki indukują
syntezę potranskrypcyjnych czynników modyfikujących, w wyniku czego pojawia się
zmodyfikowane białko.
Możliwy schemat przemian:
1.
Białko PrP o konformacji prawidłowej (globularnej).
2. W wyniku np. mutacji punktowej dochodzi do zamiany aminokwasów,
konkretniew pozycji 102 leucyny na prolinę.
3.
Powstaje wariant nieprawidłowy konformacji; płat/kartka o strukturze
beta.
1 2 3 4 5 6 Dalej..
Przypisy: [ 13 ] Ekson
(egzon, sekwencja kodująca) — w komórkach eukariotycznych odcinek genu kodujący
sekwencję aminokwasów w cząsteczce białka. [ 15 ] Jeśli
czynnik scrapie zawiera genom kwasu nukleinowego, to musi on być tysiąc
razy mniejszy od genomu najmniejszego znanego wirusa (R. Rhodes, 2000 r.). [ 16 ] W istocie biosynteza odbywa się zwykle w tzw. polisomach (polirybosomy, informosomy), strukturach odkrytych w roku
1963. Polisom utworzony jest przez zespół rybosomów związanych z jedną
cząsteczką mRNA i prowadzących jej translację, czyli syntezę białek. Polisomy
mogą występować w postaci pojedynczych ziarenek w cytoplazmie, bądź systemu
rybosomów przyczepionych do błon siateczki śródplazmatycznej szorstkiej (ER-g).
Umożliwiają efektywniejsze wykorzystanie matrycy mRNA w czasie — jednocześnie na
jednej nici mRNA wiele pojedynczych rybosomów syntetyzuje wiele łańcuchów
peptydowych, zanim zostanie rozłożona. System ten jest szczególnie wydajny u
Eukaryota.
Pierwszymi
białkami, których skład i sekwencję aminokwasów poznano, była insulina (51
aminokwasów)i rybonukleaza (124).
[ 19 ] Występuje
zarazem w białkach o dużej wytrzymałości mechanicznej, np. w keratynie
(włosy, naskórek), miozynie (mięśnie). [ 22 ] denaturacja — zniszczenie struktury III-rzędowej, np. w wyniku wysokich temperatur,
obecności mocznika, znacznych zmian pH, detergentów, jonów metali ciężkich. [ 25 ] Hipotezy konwersji i propagacji PrP: 1.
model
polimeryzacji — zakłada tworzenie się ziaren — ośrodków agregacji powodujących
zmianę konformacji kolejnych cząstek PrPc
hipoteza
szablon-pomocnik (template-assistance) /hipoteza heterodimerów — PrPc
wiąże się z PrPSc lub nieprawidłowo sfałdowanym białkiem
prionowym (heterodimer), po czym ulega przekształceniu do PrPSc -
powstaje homodimer, który rozłącza się, aby utworzyć kolejne heterodimery. [ 26 ] in.
Kreutzfeldta Jakoba [ 27 ] Prawdopodobny
mechanizm powodujący formowanie złogów przez białka prionowe (trafiają do
cytozolu zamiast do błony komórkowej) przedstawiony jest w T. Ishikawa, op.
cit., s.6-7. « Biologia molekularna (Publikacja: 24-02-2011 Ostatnia zmiana: 25-02-2011)
Wszelkie prawa zastrzeżone. Prawa autorskie tego tekstu należą do autora i/lub serwisu Racjonalista.pl.
Żadna część tego tekstu nie może być przedrukowywana, reprodukowana ani wykorzystywana w jakiejkolwiek formie,
bez zgody właściciela praw autorskich. Wszelkie naruszenia praw autorskich podlegają sankcjom przewidzianym w
kodeksie karnym i ustawie o prawie autorskim i prawach pokrewnych.str. 951 |
|